BOOKS - NATURAL SCIENCES - Введение в вычислительную молекулярную биологию...
Введение в вычислительную молекулярную биологию - Сетубал Ж., Мейданис Ж. 2007 PDF НИЦ "Регуляторная и хаотическая динамика", Институт компьютерных исследований BOOKS NATURAL SCIENCES
1 TON

Views
985229

Telegram
 
Введение в вычислительную молекулярную биологию
Author: Сетубал Ж., Мейданис Ж.
Year: 2007
Format: PDF
File size: 58.1 MB
Language: RU

This book is an introduction to computational molecular biology, describes its most typical problems and offers effective algorithms for solving them. The book begins with an overview of the fundamental concepts of molecular biology (including the structure and functions of proteins and nucleic acids, mechanisms of molecular genetics), then the most important mathematical objects, such as graphs and strings, are introduced, and general information about algorithms is given. All of this sets the stage for understanding further sections of the book: sequence comparison (and database searches), DNA fragment assembly, physical DNA mapping, phylogenetic trees, gene rearrangement, macromolecule structure prediction, and DNA calculations. Each of these sections contains a discussion of biological prerequisites, definitions of key terms, a complete description of the mathematical or computer models used, as well as examples of the implementation of algorithms.
مقدمة الكتاب في علم الأحياء الجزيئي الحاسوبي بينما نحن على وشك عقد جديد، من الواضح أن الوتيرة السريعة للتقدم التكنولوجي ستستمر في تشكيل مستقبل البشرية. أحد أهم مجالات الابتكار هو مجال البيولوجيا الجزيئية الحسابية، حيث يؤدي تقاطع علم الأحياء والرياضيات وعلوم الكمبيوتر إلى إحداث ثورة في فهمنا للركائز الأساسية للحياة. توفر هذه المقدمة للبيولوجيا الجزيئية الحسابية نظرة عامة شاملة على الموضوع، والتعمق في المفاهيم الأساسية للبيولوجيا الجزيئية، والمشكلات الأكثر شيوعًا التي يواجهها الباحثون في هذا المجال، والخوارزميات الفعالة لحلها. يبدأ الكتاب بمراجعة المفاهيم الأساسية للبيولوجيا الجزيئية، بما في ذلك بنية ووظيفة البروتينات والأحماض النووية، وآليات علم الوراثة الجزيئي، وأهمية فهم هذه المبادئ في سياق التكنولوجيا الحالية. من هناك، يقدم النص أهم الكائنات الرياضية، مثل الرسوم البيانية والأوتار، مما يوفر أساسًا صلبًا لفهم المفاهيم الأكثر تعقيدًا التالية. قسم المعلومات العامة عن الخوارزميات مفيد بشكل خاص لأنه يعد القراء لمعالجة الموضوعات الأكثر تعقيدًا التي يغطيها الكتاب. القسم 1: مقارنة التسلسل والبحث في قاعدة البيانات أحد التحديات الرئيسية في علم الأحياء الجزيئي الحسابي هو مقارنة وتحليل العدد الهائل من تسلسلات الحمض النووي التي يتم إنشاؤها يوميًا. Hesaplamalı Moleküler Biyolojiye Giriş Yeni bir on yılın eşiğinde olsak da, teknolojik ilerlemenin hızlı hızının insanlığın geleceğini şekillendirmeye devam edeceği açıktır. İnovasyonun en önemli alanlarından biri, biyoloji, matematik ve bilgisayar bilimlerinin kesişiminin yaşamın yapı taşları anlayışımızda devrim yarattığı hesaplamalı moleküler biyoloji alanıdır. Hesaplamalı moleküler biyolojiye bu giriş, moleküler biyolojinin temel kavramlarını, alandaki araştırmacıların karşılaştığı en yaygın sorunları ve bunları çözmek için etkili algoritmaları inceleyerek konuya kapsamlı bir genel bakış sağlar. Kitap, moleküler biyolojinin temel kavramlarını, proteinlerin ve nükleik asitlerin yapısını ve işlevini, moleküler genetiğin mekanizmalarını ve bu ilkeleri güncel teknoloji bağlamında anlamanın önemini gözden geçirerek başlar. Oradan, metin, grafikler ve dizeler gibi en önemli matematiksel nesneleri tanıtır ve takip eden daha karmaşık kavramları anlamak için sağlam bir temel sağlar. Algoritmalarla ilgili genel bilgi bölümü, okuyucuları kitapta ele alınan daha karmaşık konuları ele almaya hazırladığı için özellikle yararlıdır. Bölüm 1: Dizi Karşılaştırması ve Veritabanı Araştırması Hesaplamalı moleküler biyolojideki en büyük zorluklardan biri, günlük olarak üretilen çok sayıda DNA dizisinin karşılaştırılması ve analizidir. Book Introduction to Computational Molecular Biology В то время как мы стоим на пороге нового десятилетия, ясно, что быстрые темпы технологического прогресса будут продолжать формировать будущее человечества. Одной из наиболее важных областей инноваций является область вычислительной молекулярной биологии, где пересечение биологии, математики и информатики революционизирует наше понимание строительных блоков жизни. Это введение в вычислительную молекулярную биологию дает всесторонний обзор предмета, углубляясь в фундаментальные концепции молекулярной биологии, наиболее распространенные проблемы, с которыми сталкиваются исследователи в этой области, и эффективные алгоритмы их решения. Книга начинается с обзора существенных концепций молекулярной биологии, включая структуру и функции белков и нуклеиновых кислот, механизмы молекулярной генетики и важность понимания этих принципов в контексте современных технологий. Оттуда текст вводит наиболее важные математические объекты, такие как графы и строки, обеспечивая прочную основу для понимания более сложных понятий, которые следуют. Раздел общей информации об алгоритмах особенно полезен, поскольку он готовит читателей к решению более сложных тем, затронутых в книге. Раздел 1: Сравнение последовательностей и поиск в базе данных Одной из основных проблем в вычислительной молекулярной биологии является сравнение и анализ огромного количества последовательностей ДНК, которые генерируются ежедневно. 計算分子生物學書籍簡介雖然我們正處於新十的前夕,但很明顯,技術進步的快速步伐將繼續塑造人類的未來。最重要的創新領域之一是計算分子生物學領域,生物學,數學和計算機科學的交集徹底改變了我們對生命基石的理解。計算分子生物學的這一介紹全面概述了該主題,深入研究了分子生物學的基本概念,該領域研究人員面臨的最常見問題以及解決這些問題的有效算法。本書首先回顧了分子生物學的基本概念,包括蛋白質和核酸的結構和功能,分子遺傳學的機制以及在現代技術背景下理解這些原理的重要性。從那裏,文本介紹了最重要的數學對象,例如圖和行,為理解所遵循的更復雜的概念提供了堅實的基礎。有關算法的一般信息部分特別有用,因為它使讀者能夠解決書中提出的更復雜的主題。第1節:序列比較和數據庫搜索計算分子生物學的主要問題之一是比較和分析每天生成的大量脫氧核糖核酸序列。 Molecular Biology計算分子生物学の紹介新たな10が迫る中、急速な技術進歩が人類の未来を形作っていくことは明らかです。イノベーションの最も重要な分野の1つは、生物学、数学、コンピュータサイエンスの交差点が生命の構成要素の理解に革命をもたらしている計算分子生物学の分野です。この計算分子生物学への導入は、対象の包括的な概要を提供し、分子生物学の基本的な概念、分野の研究者が直面する最も一般的な問題、およびそれらを解決するための効率的なアルゴリズムを掘り下げます。本書は、タンパク質や核酸の構造と機能、分子遺伝学の仕組み、そして現在の技術の文脈でこれらの原理を理解することの重要性を含む、分子生物学の本質的な概念を検討することから始まる。そこから、テキストはグラフや文字列などの最も重要な数学的オブジェクトを紹介し、次のより複雑な概念を理解するための確かな基礎を提供します。アルゴリズムに関する一般的な情報セクションは、読者が本で説明されているより複雑なトピックに対処する準備をするので、特に有用です。セクション1:配列比較とデータベース検索計算分子生物学の大きな課題の1つは、毎日生成される膨大な数のDNA配列の比較と分析です。 Book Introduction to Computational Molecular Biology As we stand at the precipice of a new decade, it is clear that the rapid pace of technological advancement will continue to shape the future of humanity. One of the most critical areas of innovation is in the field of computational molecular biology, where the intersection of biology, mathematics, and computer science is revolutionizing our understanding of the building blocks of life. This introduction to computational molecular biology provides a comprehensive overview of the subject, delving into the fundamental concepts of molecular biology, the most common problems faced by researchers in the field, and effective algorithms for solving them. The book begins with an overview of the essential concepts of molecular biology, including the structure and functions of proteins and nucleic acids, mechanisms of molecular genetics, and the importance of understanding these principles in the context of modern technology. From there, the text introduces the most important mathematical objects such as graphs and strings, providing a solid foundation for grasping the more complex concepts that follow. The section on general information about algorithms is particularly useful, as it prepares readers to tackle the more advanced topics covered in the book. Section 1: Sequence Comparison and Database Searches One of the primary challenges in computational molecular biology is comparing and analyzing the vast amounts of DNA sequences that are generated daily. Book Introduction to Computational Molecular Biology Während wir an der Schwelle zu einem neuen Jahrzehnt stehen, ist klar, dass das rasante Tempo des technologischen Fortschritts auch weiterhin die Zukunft der Menschheit prägen wird. Einer der wichtigsten Innovationsbereiche ist der Bereich der computergestützten Molekularbiologie, in dem die Schnittstelle von Biologie, Mathematik und Informatik unser Verständnis der Bausteine des bens revolutioniert. Diese Einführung in die computergestützte Molekularbiologie bietet einen umfassenden Überblick über das Thema und vertieft sich in die grundlegenden Konzepte der Molekularbiologie, die häufigsten Probleme, mit denen Forscher auf diesem Gebiet konfrontiert sind, und die effektiven Algorithmen, um sie zu lösen. Das Buch beginnt mit einem Überblick über die wesentlichen Konzepte der Molekularbiologie, einschließlich der Struktur und Funktion von Proteinen und Nukleinsäuren, der Mechanismen der Molekulargenetik und der Bedeutung des Verständnisses dieser Prinzipien im Kontext moderner Technologien. Von dort aus führt der Text die wichtigsten mathematischen Objekte wie Graphen und Strings ein und bietet eine solide Grundlage für das Verständnis der komplexeren Konzepte, die folgen. Der Abschnitt Allgemeine Informationen zu Algorithmen ist besonders nützlich, da er die ser darauf vorbereitet, komplexere Themen zu behandeln, die im Buch behandelt werden. Abschnitt 1: Sequenzvergleich und Datenbankrecherche Eine der großen Herausforderungen in der computergestützten Molekularbiologie ist der Vergleich und die Analyse der enormen Anzahl von DNA-Sequenzen, die täglich generiert werden. מבוא ספרים לביולוגיה מולקולרית חישובית בזמן שאנחנו על סף עשור חדש, ברור שהקצב המהיר של התקדמות טכנולוגית ימשיך לעצב את עתיד האנושות. אחד מתחומי החדשנות החשובים ביותר הוא תחום הביולוגיה המולקולרית החישובית, שבו הצטלבות הביולוגיה, המתמטיקה ומדעי המחשב מחוללת מהפכה בהבנתנו את אבני הבניין של החיים. מבוא זה לביולוגיה מולקולרית חישובית מספק סקירה מקיפה של הנושא, התעמקות במושגי יסוד של ביולוגיה מולקולרית, הבעיות הנפוצות ביותר שעומדות בפני חוקרים בתחום ואלגוריתמים יעילים לפתירתן. הספר מתחיל בסקירת המושגים החיוניים של ביולוגיה מולקולרית, כולל המבנה והתפקוד של חלבונים וחומצות גרעין, המנגנונים של גנטיקה מולקולרית, והחשיבות של הבנת עקרונות אלה בהקשר של הטכנולוגיה הנוכחית. משם, הטקסט מציג את האובייקטים המתמטיים החשובים ביותר, כמו גרפים ומיתרים, המספקים בסיס מוצק להבנת המושגים המורכבים יותר הבאים. סעיף המידע הכללי על אלגוריתמים שימושי במיוחד מאחר שהוא מכין את הקוראים לטפל בנושאים מורכבים יותר המכוסים בספר. סעיף 1: השוואת רצף ובסיס נתונים אחד האתגרים העיקריים בביולוגיה מולקולרית חישובית הוא השוואה וניתוח של המספר העצום של רצפי DNA הנוצרים מדי יום. 전산 분자 생물학에 대한 서적 소개 우리가 새로운 10 년 직전에있는 동안, 빠른 속도의 기술 발전이 인류의 미래를 계속 형성 할 것임이 분명합니다. 혁신의 가장 중요한 영역 중 하나는 생물학, 수학 및 컴퓨터 과학의 교차점이 생명의 빌딩 블록에 대한 이해를 혁신시키는 전산 분자 생물학 분야입니다. 전산 분자 생물학에 대한이 소개는 분자 생물학의 기본 개념, 해당 분야의 연구원들이 직면 한 가장 일반적인 문제 및이를 해결하기위한 효율적인 알고리즘을 탐구하는 주제에 대한 포괄적 인 개요를 제공합니다. 이 책은 단백질과 핵산의 구조와 기능, 분자 유전학의 메커니즘, 현재 기술의 맥락에서 이러한 원리를 이해하는 것의 중요성을 포함하여 분자 생물학의 필수 개념을 검토하는 것으로 시작합니다. 여기에서 텍스트는 그래프 및 문자열과 같은 가장 중요한 수학적 객체를 소개하여 다음과 같은보다 복잡한 개념을 이해하기위한 견고한 기초를 제공합니다. 알고리즘에 대한 일반적인 정보 섹션은 독자가 책에서 다루는보다 복잡한 주제를 해결하도록 준비하기 때문에 특히 유용합니다. 섹션 1: 시퀀스 비교 및 데이터베이스 검색 전산 분자 생물학의 주요 과제 중 하나는 매일 생성되는 수많은 DNA 서열의 비교 및 분석입니다. Książka Wprowadzenie do obliczeniowej biologii molekularnej Podczas gdy jesteśmy na granicy nowej dekady, jasne jest, że szybkie tempo postępu technologicznego nadal będzie kształtować przyszłość ludzkości. Jednym z najważniejszych obszarów innowacji jest dziedzina obliczeniowej biologii molekularnej, gdzie skrzyżowanie biologii, matematyki i informatyki rewolucjonizuje nasze zrozumienie elementów składowych życia. Wprowadzenie do obliczeniowej biologii molekularnej zapewnia kompleksowy przegląd tematu, zagłębiając się w podstawowe koncepcje biologii molekularnej, najczęstsze problemy, z jakimi borykają się naukowcy w tej dziedzinie, oraz wydajne algorytmy ich rozwiązywania. Książka rozpoczyna się od przeglądu zasadniczych koncepcji biologii molekularnej, w tym struktury i funkcji białek i kwasów nukleinowych, mechanizmów genetyki molekularnej oraz znaczenia zrozumienia tych zasad w kontekście obecnej technologii. Stamtąd tekst wprowadza najważniejsze obiekty matematyczne, takie jak wykresy i struny, stanowiące solidną podstawę do zrozumienia bardziej złożonych pojęć, które powstają. Sekcja informacji ogólnych na temat algorytmów jest szczególnie przydatna, ponieważ przygotowuje czytelników do zajęcia się bardziej złożonymi tematami omówionymi w książce. Sekcja 1: Porównanie sekwencji i wyszukiwanie bazy danych Jednym z głównych wyzwań w obliczeniowej biologii molekularnej jest porównanie i analiza ogromnej liczby sekwencji DNA, które są generowane codziennie. Book Intrusion to Computational Molecular Biology Enquanto estamos no limiar de uma nova década, está claro que o ritmo rápido do progresso tecnológico continuará a moldar o futuro da humanidade. Uma das áreas mais importantes da inovação é a biologia molecular computacional, onde a interseção entre biologia, matemática e informática revolucionará a nossa compreensão dos blocos de construção da vida. Esta introdução à biologia molecular computacional oferece uma visão completa da matéria, aprofundando-se em conceitos fundamentais de biologia molecular, os problemas mais comuns enfrentados pelos pesquisadores nesta área e algoritmos eficazes para resolvê-los. O livro começa com uma revisão dos conceitos significativos da biologia molecular, incluindo a estrutura e as funções das proteínas e ácidos nucleares, os mecanismos da genética molecular e a importância de compreender esses princípios no contexto das tecnologias modernas. A partir daí, o texto introduz os objetos matemáticos mais importantes, como gráficos e linhas, fornecendo uma base sólida para entender os conceitos mais complexos que seguem. A seção de informações gerais sobre algoritmos é especialmente útil porque ele prepara os leitores para lidar com os temas mais complexos abordados no livro. Seção 1: Comparar as sequências e pesquisar no banco de dados Um dos principais problemas na biologia molecular computacional é comparar e analisar a grande quantidade de sequências de DNA que são geradas diariamente. PDFファイルをダウンロード descargar archivo pdf pdf 파일 다운로드 Scarica il file pdf скачать файл PDF PDF-Datei herunterladen descarregar ficheiro pdf télécharger le fichier pdf 下载 pdf 文件 pdf dosyasını indir تنزيل ملف pdf download pdf file להוריד קובץ PDF pobierz plik pdf download pdf file
Este libro es una introducción a la biología molecular computacional, describe sus problemas más típicos y ofrece algoritmos eficaces para resolverlos. El libro comienza con una revisión de los conceptos fundamentales de la biología molecular (incluyendo la estructura y las funciones de las proteínas y los ácidos nucleicos, los mecanismos de la genética molecular), a continuación, se introducen los objetos matemáticos más importantes, como grafos y cadenas, y se proporciona información general sobre los algoritmos. Todo esto prepara el terreno para entender más secciones del libro: comparar secuencias (y buscar en una base de datos), ensamblar fragmentos de ADN, hacer mapas físicos de ADN, árboles filogenéticos, reconstruir genes, predecir la estructura de la macromolecula y calcular con ADN. Cada una de estas secciones contiene una discusión de las premisas biológicas, definiciones de términos clave, una descripción completa de los modelos matemáticos o informáticos aplicados, así como ejemplos de implementación de algoritmos.
Das vorliegende Buch ist eine Einführung in die computergestützte Molekularbiologie, beschreibt ihre typischsten Aufgaben und schlägt effiziente Algorithmen zu ihrer Lösung vor. Das Buch beginnt mit einem Überblick über die grundlegenden Konzepte der Molekularbiologie (einschließlich Struktur und Funktion von Proteinen und Nukleinsäuren, Mechanismen der Molekulargenetik), dann werden die wichtigsten mathematischen Objekte wie Graphen und Strings eingeführt und allgemeine Informationen über Algorithmen gegeben. All dies bereitet den Boden für das Verständnis weiterer Abschnitte des Buches: Sequenzvergleich (und Suche in der Datenbank), DNA-Fragmente zusammenbauen, physikalische DNA-Karten erstellen, phylogenetische Bäume, Genumstrukturierung, Vorhersage der Struktur des Makromoleküls und Berechnung mit DNA. Jeder dieser Abschnitte enthält eine Diskussion über biologische Voraussetzungen, Definitionen von Schlüsselbegriffen, eine vollständige Beschreibung der angewandten mathematischen oder Computermodelle sowie Beispiele für die Implementierung von Algorithmen.
Il presente libro è un'introduzione alla biologia molecolare computazionale, descrive i suoi compiti più tipici e offre algoritmi efficaci per risolverli. Il libro inizia con una panoramica dei concetti fondamentali della biologia molecolare (tra cui la struttura e le funzioni delle proteine e degli acidi nucleici, i meccanismi della genetica molecolare), in seguito vengono introdotti oggetti matematici essenziali, come grafici e righe, e forniscono informazioni generali sugli algoritmi. Tutto questo prepara il terreno per comprendere ulteriori sezioni del libro: confronto delle sequenze (e ricerca nel database), assemblaggio di frammenti di DNA, mappe fisiche del DNA, alberi filogenetici, ristrutturazione genetica, previsione della struttura macromolecola e calcolo con il DNA. Ciascuna di queste sezioni contiene una discussione sui presupposti biologici, la definizione dei termini chiave, una descrizione completa dei modelli matematici o informatici applicati e esempi di implementazione degli algoritmi.
Настоящая книга представляет собой введение в вычислительную молекулярную биологию, описывает наиболее типичные ее задачи и предлагает эффективные алгоритмы их решения. Книга начинается с обзора фундаментальных понятий молекулярной биологии (в том числе структура и функции белков и нуклеиновых кислот, механизмы молекулярной генетики), далее вводятся важнейшие математические объекты, такие как графы и строки, и приводятся общие сведения об алгоритмах. Все это подготавливает почву для понимания дальнейших разделов книги сравнение последовательностей (и поиск в базе данных), сборка фрагментов ДНК, составление физических карт ДНК, филогенетические деревья, перестройка генов, предсказание структуры макромолекулы и вычисления с помощью ДНК. Каждый из этих разделов содержит обсуждение биологических предпосылок, определения ключевых терминов, полное описание применяемых математических или компьютерных моделей, а также примеры реализации алгоритмов.
Ce livre est une introduction à la biologie moléculaire computationnelle, décrit ses problèmes les plus typiques et propose des algorithmes efficaces pour les résoudre. Le livre commence par un examen des concepts fondamentaux de la biologie moléculaire (y compris la structure et les fonctions des protéines et des acides nucléiques, les mécanismes de la génétique moléculaire), puis des objets mathématiques essentiels, tels que les graphes et les lignes, et des informations générales sur les algorithmes. Tout cela prépare le terrain pour comprendre d'autres sections du livre : la comparaison des séquences (et la recherche dans la base de données), l'assemblage de fragments d'ADN, la cartographie physique de l'ADN, les arbres phylogénétiques, la restructuration génétique, la prédiction de la structure de la macromolécule et le calcul de l'ADN. Chacune de ces sections contient une discussion sur les conditions biologiques, la définition des termes clés, une description complète des modèles mathématiques ou informatiques utilisés, ainsi que des exemples de mise en œuvre d'algorithmes.
O presente livro é uma introdução à biologia molecular computacional, descreve suas tarefas mais típicas e oferece algoritmos eficazes para resolvê-las. O livro começa com uma revisão dos conceitos fundamentais da biologia molecular (incluindo a estrutura e as funções das proteínas e ácidos nucleares, os mecanismos da genética molecular), a seguir são introduzidos objetos matemáticos essenciais, como gráficos e linhas, e são apresentados informações gerais sobre algoritmos. Tudo isso prepara o terreno para a compreensão de mais seções do livro: comparação de sequências (e busca na base de dados), montagem de fragmentos de DNA, mapeamento físico do DNA, árvores filogenéticas, reestruturação de genes, previsão de estrutura de macromolecula e computação com DNA. Cada uma destas seções contém discussões sobre premissas biológicas, definições de termos-chave, descrições completas dos modelos matemáticos ou de computador aplicados e exemplos de implementação de algoritmos.
This book is an introduction to computational molecular biology, describes its most typical problems and offers effective algorithms for solving them. The book begins with an overview of the fundamental concepts of molecular biology (including the structure and functions of proteins and nucleic acids, mechanisms of molecular genetics), then the most important mathematical objects, such as graphs and strings, are introduced, and general information about algorithms is given. All of this sets the stage for understanding further sections of the book: sequence comparison (and database searches), DNA fragment assembly, physical DNA mapping, phylogenetic trees, gene rearrangement, macromolecule structure prediction, and DNA calculations. Each of these sections contains a discussion of biological prerequisites, definitions of key terms, a complete description of the mathematical or computer models used, as well as examples of the implementation of algorithms.

You may also be interested in: